為了進一步優化財政支出結構、提高財政資金使用效率，根據省人大財經委的要求，并征求省財政廳意見后，甘肅省審計廳于2010年9月16日起，對2009年度省級財政支出結構情況進行審計調查，這也是甘肅省首次對省級財政支出結構情況進行審計調查。
此次審計調查的重點：一是從制度層面檢查財政管理體制的健全性、制度的完善性以及管理的有效性。二是從預算源頭控制方面檢查預算編制的完整性以及預算執行的嚴肅性。三是檢查財政支出結構的科學、合理性。四是檢查省級財政在擴大內需、節能減排、經濟發展方式轉變、產業結構調整、區域發展戰略以及財源培植、縣域經濟發展等重大政策落實等方面的財力保障情況。五是檢查財政經濟建設資金的監督管理、評價、責任追究等制度是否健全、有效，揭示投資制度存在的缺陷以及政府在投資模式上存在的問題。
此次審計調查的主要內容：一是摸清省級行政管理支出、經濟建設支出和民生支出的總體規模，掌握增長變動情況和變化趨勢，分析預算安排的合理性和資金使用的效益性。二是檢查評價省級財政部門在節約行政成本方面采取的主要措施、取得的成效以及存在的主要問題。三是檢查省級財政部門是否按規定將各類收費資金等全部納入預算管理，預算單位有無不受監督、游離于預算之外的政府性資金以及“敞口花錢” 等問題。四是檢查省級行政管理成本的內部構成情況，分析省級行政事業單位工資性支出、公務支出占行政管理成本的比重，重點檢查有關部門是否存在招待費居高不下、公車消費、公款旅游等問題；分析工資性支出、公務支出與GDP、財政支出規模、物價指數、消費水平之間的比例關系；對照相關省市數據，分析我省工資水平、增長幅度與國民收入結構調整政策等方面存在的問題。五是掌握經營性投入、公益性投入占經濟建設支出的比例，重點檢查是否存在投資結構不合理、投資規模不適當、投資效益低下等問題。六是檢查民生政策的落實情況，重點檢查社保、教育、衛生、三農、住房等財政資金的保障及撥付情況。揭示政策落實不到位、資金撥付不及時、滯留、挪用民生資金等問題。
這次審計調查采取重點檢查與調查研究相結合的方法，大量采用數據統計、比較分析、比率分析、重點抽查、典型分析等方法，做到重點檢查和調查的有機結合。嚴格按照《審計機關審計項目質量控制辦法（試行）》等規定的審計程序、質量要求實施審計調查。審計調查除采取審查賬簿資料、抽查核實外，還將采取實地考察、座談、走訪等多種方式，既要從財政部門入手把握全局，還要從抽查部門（單位）入手，夯實基礎、突出重點、抓住典型，并做好兩方面內容的銜接工作。
通過審計調查、綜合分析，全面、總體掌握近年來省級財政支出總規模占國民生產總值比重以及財政支出內部各構成要素占省級財政支出總量的比例，主要掌握行政性支出、經濟建設支出、民生項目支出占當年財政支出的比重，全面、客觀地反映和評價政府介入社會經濟生活的范圍和力度以及宏觀經濟運行情況和預決算情況，針對調查中發現的主要問題，分析原因，提出意見和建議，促進財政部門調整和優化財政支出結構和支出用途，強化預算編制源頭控制，增強政府宏觀調控能力，合理配置財政資金，提高資金使用效益。（李芙蓉）
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