江蘇省邳州市審計局在每年的新型農村合作醫療基金審計中，都要深入基層，跟蹤審計年度基金使用情況，針對發現的問題，向市委、市政府及衛生部門提出合理化建議。2009年該市根據審計建議并結合實際，對存在補償手續、金額和有關監管等問題進行整改，出臺多項措施，取得很好效果。
修訂下發了《邳州市新型農村合作醫療管理辦法》，出臺了新的補償方案。鎮、村門診補償由原來的20％提高到30％，縣、鎮兩級醫院住院取消分段補償，鎮衛生院補償標準為55％，縣級醫院住院補償標準為45％，市級及以上醫院住院分段補償起點由30％提高到40％，最高補償達到80％，最高補償限額由每人每年4萬元，提高到8萬元，最大限度地提高農民受益程度。
加大三級監管力度。該市合管辦監督全市農合基金運行情況，各鎮合管辦監督轄區內定點醫療機構和村衛生室執行農合政策、兌付農合補償費用等情況，各行政村也都成立了監管小組，對農合資金補償情況進行監督。
實行“四公示”、“五合理”制度。定點醫療機構和村衛生室在醒目位置要公示主要服務項目收費標準、常用藥品價格、參合農民醫療費用補償情況和監督舉報電話；并且做到合理檢查、合理診斷、合理治療、合理用藥、合理收費，建立行之有效的新農合醫療機構的自律機制。
健全長效機制，完善網絡管理。建立計算機管理網絡系統，實行聯網管理，門診、住院補償均實行刷卡補償，并為各定點醫療機構和村衛生室配置電腦，與市合管辦中心管理系統實行數據信息共享，24小時受其監控,確保了農合基金安全運行。（ 胡德才）
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